Программа 1С: Зарплата и кадры построена на требованиях НК, ТК и МинТруда и содержит массу ограничений, препятствующих расчетчику нарушать законодательство.  Для его же пользы.  И если на предприятии высшим законодательным органом является босс, свирепеющий при упоминании слова «Кодекс», то лучшим решением будет отказ от ЗиК вообще, и применение НалогоплательщикаЮЛ, Екселя и чего угодно другого © VZ

В этой статье использованы фрагменты вопросов и ответов из форума Т1С.  Особую благодарность я хочу выразить Геннадию и VZ за четкое знание законодательной базы, а так же всем форумчанам за иногда наивные, а иногда и просто забавные вопросы.  Без Вас я бы никогда не решился написать эту статью.

1.1. Заполнения плана счетов.1. С чего начать?

Скажу прописную истину: работа с программой начинается с ее настройки. Делать это должен Программист, но при непосредственном контроле бухгалтера. От выбора Правильного Программиста всецело зависит успешность внедрения программы.
Поэтому не привлекайте «студентов». Правильный Программист стоит дорого, но еще дороже будет ошибка, которую заметят в конце года в момент сдачи отчетности.
Часто на форуме задается вопрос «а сколько сотрудников реально рассчитывать в программе ЗиК»? Отвечаю: вполне реально рассчитывать 6-7 тыс человек, практически без переделок, с переделками еще больше. 
Только нужно грамотно разделять ввод и отчетную информацию - при такой численности все отчеты следует получать на «вчерашней» копии, общий расчет зарплаты ставить на ночь, а всю первичку вынести в отдельную базу и настроить односторонний обмен.
2-3 тысячи человек программа отработает вообще безо всяких вопросов.

Я не буду останавливаться на вводе названия и адреса ввиду их очевидности, а остановлюсь, пожалуй, на настройке шаблона проводок(ШП).
Вообще говоря, ШП в ЗиКе довольно криво реализованы и требуют уймы времени на свою работу, но об этом потом.
Замечу только, что адреса нужно вводить по адресному классификатору, который необходимо импортировать в ЗиК обработкой «Загрузка классификатора»

Делается это через выгрузку плана счетов из 1С:Бухгалтерии.
В тех случаях, когда бух учет ведется не в программе 1С, в настройках предусмотрен соответствующий пункт списка.
В 1С:Бухгалтерии нужно зайти в пункт меню Сервис-Обмен данными-Выгрузка данных в ЗиК. Ставим все галочки, указываем ПУТЬ и нажимаем «Выгрузить». 
Рекомендуется в бухгалтерии, до выгрузки в ЗиК, на всех затратных счетах указать необходимую аналитику (например, статьи затрат «Зарплата», «ЕСН»), т.е. завести элементы справочников Статьи затрат на производство, Статьи общехозяйственных затрат, Статьи общепроизводственных затрат, Статьи издержек обращения, чтобы после выгрузки в ЗиК было из чего выбирать. Если это не сделать сразу, то потом, когда половина проводок уже будет настроена, повторная загрузка может либо вообще не загрузится, либо загрузиться так, что лучше б она не грузилась совсем. 
В 1С:ЗиК заходим в Сервис-Обмен данными -Загрузка данных, указываем ПУТЬ и нажимаем «Загрузить данные»
Если же в настройках программы поставить «Другая программа бухучета...» то просто заходим в план счетов и нажимаем кнопочку «Заполнить».
Я уже говорил, что шаблоны в ЗиКе корявые? Что говорил, да? Ну и ладно, еще не раз скажу!
Ну, а если ваш план счетов отличается от стандартного – курите бамбук. ЗиК не умеет работать с нестандартным ПС.
Почти не умеет.

1.2. настройка шаблона проводок (ШП).

Вообще говоря, шаблоны имеют следующую иерархию(в порядке убывания):
-Документ, поле ШаблонПроводки -Вид расчета
-Сотрудник
-Подразделение
-Константа ПроводкаПоУмолчанию
Это означает, что проводка по сотруднику перекрывает проводку по подразделению, в котором этот сотрудник находится. 
Вообще говоря, настройка шаблона по отдельному сотруднику должна быть исключительным случаем. Намного удобнее вводить шаблон в целом по подразделению или по предприятию.

Отдельно от иерархии стоит специальный документ «Бухгалтерский, налоговый учет начислений и удержаний»
Для начала открываем справочник видов расчета и на закладке удержания находим «НДФЛ». Открываем его и щелкаем по закладке «бухгалтерский учет».
Нажав на педальку «...» откроется мастер, помогающий ввести шаблон. Рекомендую называть шаблоны нормальными именами, их потом проще найти.
В типовом хозрасчетном ПС проводка будет Дебет 70 Кредит 68.1 Субконто1 = «Налог»
Записываем этот шаблон и сохраним вид расчета НДФЛ.
Теперь перейдем на закладку «ЕСН и страховые взносы» и точно так же настроим все виды расчета в этой группе. Дебет этих шаблонов не заполняется, он будет взят из соответствующего подразделения или сотрудника. Типовые шаблоны для хозрасчетной организации будут такими:
ПФР: Накопительная Дебет «» Кредит 69.2.3 Субконто1 = «Налог»
ПФР: Страховая Дебет «» Кредит 69.2.2 Субконто1 = «Налог»
ПФР: Федеральный Дебет «» Кредит 69.2.1 Субконто1 = «Налог»
ЕСН: ТФОМС Дебет «» Кредит 69.3.2 Субконто1 = «Налог»
ЕСН: ФФОМС Дебет «» Кредит 69.3.1 Субконто1 = «Налог»
ЕСН: ФСС Дебет «» Кредит 69.1 Субконто1 = «Налог»
В настройках программы Сервис-Настройки на закладке «Зарплата и бухучет» выбираем проводку по умолчанию обычно это Дебет 20 Кредит70. 
В справочнике видов расчета на закладке «Удержания» шаблон проводки мы настроили только на НДФЛ. Остальные удержания, если они есть, должны быть настроены ОТДЕЛЬНО!
Стоит так же отметить ввод шаблона по больничному листу. Для этого расчета обязательно нужно указать галочку «Расходы за счет» ФСС. Если этого не сделать, то в списке доступных счетов не будет счета 69.1 
Если вида расчета, по которому нужно сделать ШП, не видно в справочнике, нажмите кнопку «Помощник...» и установите переключатель на«описать предопределенный расчет», а затем выберите нужный расчет из списка.
Проводки по страхованию от несчастных случаев и другие доп.проводки настраиваются в меню Сервис - Бухучет зарплаты - Дополнительные проводки. Эти проводки попадают только в отчет «свод проводок».

1.3. Настраиваемые виды расчетов

Сразу хочу сообщить всем любителям АРМ-ов: даже не пытайтесь перетянуть из старой программы в ЗиК все расчеты, которые были в АРМ-е. Сначала разберитесь с существующими, их более чем достаточно, поверьте!
Заносить новый вид расчета нужно только в том случае, если вы полностью уверены в уникальности вашего расчета.

Собственно ввод расчета достаточно прост: в справочнике видов расчета внизу с левой стороны есть кнопочка «Помощник...» 
Следуя его указаниям, определяем вид расчета, который нам нужен. 
Пожалуй, самым сложным элементом здесь будет выбор базы расчета если расчет вообще хоть от чего то зависит! 
Все настраиваемые виды расчетов попадают на закладку «Дополнительные». Не надо их искать в «начислениях и удержаниях».

Расчеты, которые сразу попадают в журнал расчета и действуют всего один(или менее) месяц, определяются с галочкой «Начисление носит разовый характер». Если эту галочку не ставить, то расчет может действовать несколько месяцев или постоянно, это если дату окончания в документе оставить не заполненной, с момента ввода документа Ввод расчета сотруднику

Галочка «Предоставляется в денежной форме» определяет расчеты в деньгах или в натуральных продуктах. Если ее не поставить, то введенный вид расчета будет иметь вид Произвольный Натуральный Доход. Но, не смотря на то, что этот вид расчета так называется сюда же относятся и все подарки переданные сотруднику в деньгах.

Внимание! После каждого ввода нового вида расчета, внимательно следите за базой расчета налогов и доплат, зависящих от базы расчета(таких как РК и СН), а так же за кодом дохода на закладке «налоговый учет» 
Если этого не сделать сразу ошибку можно обнаружить не скоро и последствия будут не обратимыми!
База существующего расчета может меняться очень осторожно иначе при пересчете зарплаты за прошлые периоды может поменяться результат расчета.

1.4. Общие настройки

Для организаций, которые применяют районные коэффициенты в настройках предусмотрено два реквизита:
- РК утв. местными властями
- РК утв. правительством РФ
Первый используется для расчетов основных начислений, второй – для всяческих пособий из соцстраха.
Причем указывать нужно не 20% и не 0.2, а 1.2 
Это же касается всех остальных доплат (вечерние - 1.2, ночные - 1.4, сверхурочные - 1.5 и 2.0)
В случае, если РК у одного из подразделений отличается от РК организации, применяется настройка РК для обособленного подразделения. В этом случае РК может быть указан в карточке подразделения на закладке «обособленное подразделение» 
Для ввода северных надбавок сначала нужно заполнить шкалу зависимости от стажа. Делается это через меню Справочники - Расчет зарплаты -Процентные надбавки по стажу. Вводите название стажа и указываете его тип «Надбавка за стаж работы на севере». Затем откройте подчиненный справочник и введите новый элемент. Допустим, у Вас стаж такой:
от 1 года - 10%
от 3 лет - 20%
от 5 лет - 30%
в таком случае Вам потребуется три записи в шкалу процентов 
1год 0 месяцев 1 день - 10%, 3года 0 месяцев 1 день - 20% и 5лет 0 месяцев 1 день - 30%
Существует несколько голословных поверий, передаваемые из уст в уста: 
1. Северные надбавки для молодежи (до 30 лет) считаются по ускоренной шкале процентов
2. Коренные жители региона получают максимальный процент сразу при приеме на работу. Трудовой стаж им для этого не нужен.
Я не смог найти в законодательстве подтверждение этому, так что будьте бдительны, подготовьте правовую базу. Проверьте так же соответствие Вашего региона к процентным надбавкам РК и СН. Может случится так, что в Вашем регионе окажутся другие проценты, чем те что Вы считали. 
По пункту 1 есть старое постановление Совета Министров РСФСР от 22 октября 1990 г. N 458 «Об упорядочении компенсаций гражданам, проживающим в районах Севера»:
Установить, что:
е) молодежи, прожившей не менее одного года в районе Крайнего Севера и вступающей в трудовые отношения, надбавки к заработной плате устанавливаются с 1 января 1991 г. в размере 20% по истечении первых шести месяцев работы с увеличением на 20% за каждые последующие шесть месяцев, и по достижении 60% надбавки - последние 20% - за один год работы, а в местностях, приравненных к районам Крайнего Севера, и в районах, где надбавки выплачиваются в порядке и на условиях, предусмотренных постановлением ЦК КПСС, Совета Министров СССР и ВЦСПС от 6 апреля 1972 г. N 255, в размере 10% за каждые шесть месяцев работы. Общий размер выплачиваемых указанным работникам надбавок не может превышать пределов, предусмотренных действующим законодательством.
Действует ли сейчас это постановление - не известно.

Самое, пожалуй, главное: Сервис - Параметры: Число цифр года в представлении даты = 4. Это ОБЯЗАТЕЛЬНО у всех пользователей!

- Q: А у нас на предприятии ведется «двойной учет». Можно ли в ЗиК отразить «черную» зарплату?
- A: Зайдите в Сервис-Настройки-Дополнительно, поставьте Рассчитывать дополнительную зарплату. Теперь в некоторых документах и видах расчета появится галочка «Не отражать в бухгалтерском учете»,а в отчетах - переключатель «По основной зарплате» и «По дополнительной зарплате»
Учтите, что все начисления, введенные таким образом, попадают не в Журнал Расчета, а в Дополнительный Журнал Расчета. Налоги в этом журнале вообще никак не считаются. 
Замечание: смена периода в дополнительном журнале не зависит от основного журнала. Сменить период можно только войдя вдополнительный журнал расчета и нажав иконку «сменить текущий расчетный период»